螺杆泵在使用时要确保杂物不进入泵体。湿污泥中混入的固体杂物会对螺杆泵的橡胶材质定子造成损坏，所以确保杂物不进入泵的腔体是很重要的，良多污水厂在泵前加装了破碎摧毁机，也有的安装格栅装置或滤网，阻挡杂物进入螺杆泵，对于格栅应及时清捞以免造成堵塞。
还有要避免断料。螺杆泵是不可以在断料的情形下运转，一经发生，橡胶定子因为干磨擦，瞬间产生高温而烧坏，所以，破碎摧毁机完好，格栅畅通是螺杆泵正常运转的必要前提之一，为此，有些螺杆泵还在泵身上安装了断料停机装置，当发生断料时，因为螺杆泵其有自吸功能的特性，腔体内会产生真空，真空装置会使螺杆泵休止运转。
后是保持恒定的出口压力，螺杆泵是一种容积式回转泵，当出口端受阻以后，压力会逐渐升高，以至于超过预定的压力值。此时电机负荷急剧增加。传念头械相关零件的负载也会超出设计值，严峻时会发生电机烧毁、传动零件断裂。为了避免螺杆泵损坏，一般会在螺杆泵出口处安装旁通溢流阀，用以不乱出口压力，保持泵的正常运转.

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